公元201年（建安六年）后，五斗米教有了相对完整的理论和比较健全的组织体系。概言之，有3个特点：1实行政教合一，政权体制为师君和祭酒制；2实行普遍的社会救济，以笼络人心；3用黄老思想教化民众，轻刑罚，重教育，特别注重培养民众的道德观念
五斗米教初设24治，张鲁自封师君统领政教。其下24治以祭酒为首领。中央教区设在汉中阳平关（今勉县西）。24治分布于汉中、四川一带。随后，为了扩大道教的影响和势力范围，又新设游治8处，其中太华治设在京兆（西安）。各治于每年阴历十月初一聚会汉中，收纳信米，以备救灾。奉道的人，每年须会师汉中3次，进行录籍、迁赏、庆生、建功、闻科戒等活动。
公元208年（建安十三年），五斗米教的经典《老子想尔注》问世，其宗教理论进入了一新阶段。《老子想尔注》是第一部用神学注解老子《道德经》，使之符合道教宗旨的学说，最显著的标志就是把黄老理论、儒家学说、长生不老、民间信仰熔为一炉，把天、地、人、鬼、神以道贯之。目的就是为政教合一的需要服务。从而，使张修创立的五斗米教得到进一步的发展和完善。
人们不禁要问，为什么在道教史上张修鲜为人知呢?盖因张修早死，理论尚未形成；“张衡匿迹深山，无阻兵作乱事，与反逆之妖贼自异”；张鲁的理论、组织在政权的推动下，影响力比张修大。故张鲁祖陵、父衡为后世道教宗为天师。张鲁成名后尊其祖，也增强了道教的神秘色彩。
张鲁接管五斗米教后，割据汉中政权近30年，成为东汉末全国战乱之际的一方乐土。公元215年（建安二十年），曹操平定中原后，率10万大军西征，张鲁投降，被拜为镇南将军。大批天师道众随曹操北迁，汉中五斗米教政教合一的组织体系彻底瓦解。北迁以后的天师道在寇谦之（西安人）的带领下，又进行改良，迎合了朝廷，被封为“天师”，并在京城设道场。魏、晋以降，公元555年（北齐天保六年），道教与佛教论战失败，文宣帝下令废道，道士皆剃发为僧，寇谦之创新的天师道团因此散伙，取而代之的是楼观道的兴起。
五斗米教以尊奉黄帝和老子为基本信仰，把信行真道作为修行的主要目标。规定道徒的基本义务是奉守道戒，处世原则是清静无为。这些特点，对后世道教的发展奠定了基础。比如：五斗米教实行禁杀、禁酒，对后世道教的某些戒律有直接的渊源关系；对隐瞒过错者罚“治道百步”的措施，开后世民间修桥补路等善举之祖制；其置义舍接济行人的规定，也为后世全真道所继承。
那么，五斗米教为什么衰败呢?原因当然很多。主要流弊就是政教不分，把门户之见、宗派势力上升为治国安邦方略，从政治上强行推行，顺我者昌，逆我者亡，违背了广大民众的意志。尽管它有某些积极因素和合理东西，但终将被政治上的反动所湮灭。
《三国志·魏书·张鲁传》注引《典略》说：熹平中，妖贼大起，三辅有骆矅。光和中，东方有张角，汉中有张修。骆矅教民缅匿法，角为太平道，修为五斗米道。就是说，在张角传播太平道的同时，张修也在传播五斗米道。
张修，巴郡人，五斗米道一支。张衡死后，他利用身为巴人的有利条件，活动于巴郡汉中一带，发展自己的力量，史家特地将他与张角并列在同一地位。张修五斗米道所持的道法与张角基本相同。《后汉书·刘焉传》注引《典略》说：角为太平道，修为五斗米道。太平道师持九节仗为符祝，教病人叩头思过，因以符水饮之。病或自愈者，则云此人信道；其或不愈，则云不信道。
修法略与角同，加施静室，使病人处其中思过。又使人为奸令祭酒，主以《老子五千文》，使都习，号奸令.为鬼吏，主为病者请祷。请祷之法，书病人姓字，说服罪之意。作三通，其一上之天，著山上，其一埋之地，其一沈之水，谓之三官手书.使病者家出米五斗以为常，故号五斗米师也。实无益于疗病，但为淫妄，小人昏愚，竞共事之。后角被诛，修亦亡。
及鲁在汉中，因其民信其修业，遂增饰之。《后汉书·灵帝纪》注引《汉灵、献二帝纪》也说：巴郡巫人张修疗病，愈者雇以五斗米，号为五斗米师。从以上的记载中，我们可以看出，五斗米道在张修时的组织管理比张陵完善得多了。在张修的五斗米道组织中，已有一套初步的教阶系统，除了信徒外，已有神职人员和简单的教制，分管不同的教务。神职人员中有奸令、祭酒、鬼吏。入道较久者称奸令和祭酒，管理一般的鬼吏。祭酒主讲《老子五千文》，鬼吏施行符水疗病的法术。张修在符水治病方面，是将病人的姓名和服罪的意思一式三份写成文书，祈祷于三官.所谓三官，即指来源于古代神话的天官（天帝）、地官（地祇）、水官（水神）三神。
古代有的神话认为，天官赐福，地官赦罪，水官解厄。这实际上是种原始留传下来的巫术，张修承袭此说为人治病。此外，张修还首设静室，使病人处其中思过.关于静室，也叫靖室，陆修静在《道门科略》说：奉道之家，靖室是致诚之所。其外别绝，不连他屋。其中清虚，不杂余物。开闭门户，不妄触突。洒扫精肃，常若神居。唯置香炉香灯章案书刀四物而已。
必其素净，政可堪百余钱耳；比杂俗之家，床座形象幡盖众饰，不亦有繁简之殊，华素之异耶。设立静室这个制度，始于张修。
张修对五斗米道组织的完善，使五斗米道有了很大的发展，为张鲁在巴蜀建立政教合一的政权组织准备了条件。
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