这一制度彻底的结束了封建时代的那种武人拥兵自重和文人随意干涉军事行动的局面，使得中国历朝历代都为之头疼的武人乱国和文人乱军的问题得到了根本上的解决。配以统一的后勤制度，军队乱政的风险被降低到了一个非常低的地步。
但是身处其中的陈元贇却并没有这种身处历史转折点的觉悟，而是非常疑惑的问道：“督军大人，这总参谋长是个什么职位？军师吗？”。、
从字面上立即，参谋的确可以往军师这一古老的军种职位上靠拢。但很显然，萧明乾想要建立的可不是那种简单的军师制度，而是要建立一个可以在战时统筹整个国家的军事资源，制定详尽的战略的近现代参谋制度。所以，萧明乾只能耐心的向陈元贇解释了什么是参谋长，总参谋长又是个什么样的职能。
“我明白了这总参谋长其实就相当于战时的兵部尚书和国家总军师，负责战时的军事计划的制定，并给予前线主要的军事将领以最准确的信息以供其制定进一步的战术计划。那这和兵部尚书的职能不是重叠了吗？”。陈元贇将自己的理解向萧明乾述说了一边，并提出了自己的疑问。
“你的理解总的来说是没错的。至于总参谋长同兵部尚书的职能的区别，就在于总参谋长只负责军事信息的汇总分析和军事行动计划的制定。至于军队的调动，后勤的组织，军队的召集和训练等等都不在总参谋长的职权范围之内，那些便是兵部的事情了。”虽然萧明乾不会建立兵部这个部门，取而代之的只能是国防部，但是在这个时候用兵部来向陈元贇解释总参谋长的职权，也无不可。
“哦我明白了。不过，督军大人，在参谋部建立起来之前，我还只能是个光杆司令，是不是该给我几个人啊”刚才听到萧明乾提到参谋部这个职能部门，陈元贇便开始向萧明乾要人了。
“这个暂时还没有合适的人选。这样好了，我们明年建立一所军校，专门培养军事人才，其中便专门开一个参谋的专业。”
说到这里，萧明乾才发现自己的军事人才真的很缺。以往的那种偏重于实战的手把手的培养方式，似乎已经不能满足越来越大的军队需求了。所以万不得已之下，萧明乾只能提前将军校给建立起来。
“军校？”陈元贇疑惑的问道。
“没错，军校。本来我们的军事人才太少，军事方面的实际经验也太过稀少，还没那个底蕴去建立军校，可能老师都很难筹齐。但是现在台湾的军队越来越庞大，如果没有一个系统化的将领培养方式，很难满足现在的要求。总不至于永远都要让我们亲自下到军队当中去培养各级将领吧。只能先将其建立起来，至于其他的，只能走一步算一步了。”萧明乾颇为无奈的说道。
“原来这样”陈元贇稍作思考，便通识了这么做的好处，那便是可以有效的抑制军中小的利益团体的形成，使得中央，或者说是萧明乾增强对军队的掌控有很大的好处。有了这样的想法，陈元贇对萧明乾更加的敬佩了。
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