西元二十一世纪的人类社会，人口已膨胀至九十亿；而长期使用石化燃料，使的全球温度上升，造成原始生态环境的污染与破坏，为了使人类继续繁衍下去，为了保护地球上的生命，人类开始了宇宙移民计划。
太空殖民地(spacelony)的建设计划从一九九九年地球联邦政府成立便已发表，ad2045年第一号可罗尼殖民卫星(lony)开始建造，次年西历废止，改元宇宙世纪（universalcentury）；到u.c.0050为止，已有二百多个这样的圆桶型人工天体在地球与月球的四周，九十亿人口移住其中；加上月球表面的永久都市，共约有一百亿人口居住在宇宙。但是就在计划最初的目标快要达成的此时，从地球送出的殖民者开始集聚地减少，新的可罗尼殖民卫星建设工程也半途中断。原因是残留在地球的人已大多是联邦政府的高官，或是金融界、政坛的要人。这些所谓的上流阶层以近乎强迫移民的方式将人民送上太空，自己却拥有地球永久居住权而不肯移民。这对宇宙移民者来说，无疑是一种背叛行为。于是，“地球是生命之源，是圣地。人类应该全体移往宇宙，让地球以自然之力回复。”这种思想逐渐在宇宙移民者之间蔓延开来。
此时出现了一位超越时代的思想家——吉恩•；什姆•；戴肯。继承了前述思想，他大力提倡“国家主义”，主张宇宙住民的自治权，并在u.c.0052年移往离地球最远的side3（side是可罗尼殖民卫星的行政单位，约有三十至四十可罗尼殖民卫星。数字是依建造顺序决定），开始实践自己的理论。他的主张获得宇宙住民绝大的支持，在他的努力之下，于u.c.0062年，side3宣告独立，成立吉恩共和国；同时在其他的side，受到其行动的影响，反地球联邦政府的活动也越来越强烈，一时间脱离地球联邦的口号响遍宇宙。
联邦政府对side3的肚立采取了经济制裁，对各side施压，并禁止输出在地球开采的特殊矿。联邦宇宙军亦大幅增强军备，开始在月神二号(luna2)军事基地等武装施压措施。side3则将其国防队升格为国军，在经济上则争取月球上企业的协助，进行桌面上的政治，经济攻势，虽然联邦的高压政策引起宇宙住民的强烈反感，吉恩的初代首相吉恩•；什姆•；戴肯并不想使用武力或恐怖活动等强硬手段，他一直是想以外交途径让共和国获得承认，再取得联邦议会的参政权，最终目的是达到确认宇宙住民全体自治权。
然而吉恩的理想进行到一半便终止了。u.c.0068年，吉恩•；戴肯突然逝世，共和国对外发表声称吉恩是急病而死，但很多人相信他是被他的亲信，继任的首相德金•；索多•；扎比所暗杀，真相一直无法得知。而吉恩派激进份子在扎比家的座车中装设炸弹，扎比家的萨斯洛•；扎比被炸死，多兹鲁•；扎比受伤。扎比家以此开始逮捕和流芳吉恩派政治家，吉恩的两位遗孤，长子凯斯柏•；雷姆•；戴肯和长女阿尔蒂西亚•；索姆•；戴肯在吉恩系人士帮助下，秘密送往地球。
翌年side3移行公国制，德金•；索多•；扎比就任首任公王，大权落入扎比家族。施政转向寻求武力独立，开始了军事国家的建设。而联邦乘着吉恩死后的混乱局面，进行孤立side3的计划。虽然收到一些效果，但双方关系急剧恶化，几乎已到无法避免军事冲突的地步。联邦为不让吉恩公国在开战后得到各side的呼应协助，便以殖民卫星警备之名，在各side派驻驻留舰队。吉恩公国虽然在国力及疆域上处于绝对劣势，但随着米诺夫斯基粒子（由诞生于u.c.0025年的y•；t•；米诺夫斯基博士所发现的粒子。这种粒子的静止质量为零，且带有正电或带负电。这种粒子会因粒子间的电磁力和重力相互转换作用自动形成类似氯化钠分子的立方晶格。米氏粒子散布的区域，电磁波会受到严重的干扰。使雷达等探测系统失效，使传统的制导武器无法发挥效用。因为这种粒子的出现，使得战场的状况激变，退化到近似于第二次世界大战的层级，导致有目视距离战斗的武器的开发，因此随之出现的就是ms这种直接识别确认，近接战斗用的机动兵器。另外相关的技术还有米诺夫斯基核融合炉、还有米诺夫斯基漂浮载具以及i防御力场。）技术的掌握及ms（页尾做详细介绍）的开发完成，已让吉恩掌握了致胜的关键。
之后，扎比家的长男，基连•；扎比在其父德金年老后逐渐取得实权。他将吉恩的国家主义进一步扭曲，主张由宇宙住民统治地球方是正统，并将吉恩的“newtype”（页尾做详细介绍）思想转变为选民思想，认为吉恩公国的人民是最优秀的人种，煽动全国对独立战争的热潮。终于，在u.c.0079年一月三日，大战爆发。
u.c.00791月3日7时20分在从一年多前便预定好的这个日子，吉翁公国对地球联邦政府进行宣战。从这宣战布告到实际吉翁舰艇发动攻击的时间，约仅3秒钟而已.因此后人称其为“3秒钟的宣告”为此刻而装备万全的吉翁军宇宙舰艇，对绕行地球周围轨道巡弋的联邦军舰艇发起奇袭攻击。
“吉翁迈向光荣的历史，就从此役开始!”指挥官如此地鼓舞其下属。一方，以精锐ms为核心的机动舰队，，拔除第1、2、4区之防卫势力。吉翁真正的目标，，则是殖民地。攻击无武装且无辜的殖民地，其理由之一，即是向联邦军夸示实力。再者，也有摧毁联邦军据点的意义。赞同吉翁的人既都已移民第三区，那就不致把同是反地球联邦政府的宇宙居民当成攻击对象了……吉翁方面是如此推测着。
各区屯驻军，遭致真正的奇袭攻击。在尚未准备好足够的防卫机制前，便已遭击溃了。“敌人是……18公尺的机动步兵!?”“岂有此理，难道在吉翁住着独眼巨人(cyclopes)!”前线士兵对初次见到的ms十分狼狈，也缺乏对付的方法。吉翁的独眼巨人们…ms部队在未遭遇算得上是妨害的妨害下，使用装备热核弹头的火箭炮，无差别地摧毁了各殖民地。此外，为了要屠杀殖民地内的全体居民，大量投入神经毒气“g3”。该毒气是很恐怖的武器，其为无色无味无臭的气体，仅附着于皮肤上也会造成死亡。此物被使用于密闭空间的殖民地。ms的优越，一边自行进行作业，如遇敌人出现，也能立即反击，此一屠杀了28亿人以上的恐怖行动，以难以置信的速度进行着。然而，在“g3”容器连接到殖民地时，高层仅以“无致命性之催泪瓦斯”对一般士兵说明。面对此暴行，联邦军一直无法提出立即应因应之道。由于极其浓密的米诺夫斯基粒子(当然此为吉翁所散布)，各区通讯中断，虽然仍可透过微波通信等手段来联络，但发信的殖民地居民，马上便会面临死亡的命运……由宣战不到40小时的时间里，三个区的居民，约28亿人死亡。“这是无法容许的暴行!”联邦政府官员的叫嚣也是空谈，国力弱小的吉翁，为了获得本身的胜利，进而实行一件空前的计划。后来被称为“殖民地坠落”。
1月4日，21点30分，用作业箱等加以补强的第2区第8号殖民地i‘slandefficial‘，增设的核脉波引擎如同灯火闪烁减速，地球的重力吸引，进入自由落体状态。“对于愚劣的地球人民，这是审判的巨槌。神所施放的地狱火焰，将会对其伸张!”基连•；扎比嘶声力竭，高声宣言。吉翁选择的殖民地落下地点，是位于南美洲大陆的联邦军总部，贾布罗。贾布罗是在坚固岩层覆盖的洞穴里，所兴建的超巨大设施，连核子弹直接命中也能承受。但殖民地坠落造成的冲击，相当于广岛级核爆300万发的威力。在地球上还没有以此无法破坏的建物工事.就此，该作战曾多次加以模拟。吉翁军把此作战称呼为「不列颠作战(operationbritain)」，比拟为失去殖民地而国力衰退的大英帝国。
贾布罗如遭摧毁，联邦将受到物质上与精神上的重大打击，就能接受条件对吉翁有利的停战协定了…基连•；扎比如此考量。确实成功的话，将会这样吧。然而，此次联邦军的反应也果真迅速了。
1月5日12时，已集结的联邦残存舰艇，着手对殖民地与其护卫舰队进行最初的攻击。在此时的作战，确信殖民地落下目标为贾布罗的联邦军，马上由鲁纳兹调赴搭载迎击用核飞弹的舰队加以阻截。指挥这支拼凑舰队的，为当时隶属鲁纳兹的迪恩姆中将，迎击舰队与吉翁得殖民地护卫舰队的交战，由6日凌晨进行到8日，重复了多次。然而被补强的殖民地，核飞弹虽将外壁破坏到几近崩解，外型尚还算完整。
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