厥明六日，清师入。二公衣冠南面坐，兵士望见，以为神，不敢入，乃发数千人围之。被执。式耜欲入与妾诀，同敞牵臂止之曰：“徒乱人意耳。”遂行。见定南。定南曰：“汝阁部耶？好阁部。”式耜曰：“汝王子耶？好王子。”定南箕踞于地，曰：“坐。”式耜曰：“我不惯趺坐。”定南肃然起，且揖之。见同敞，曰：“汝何人？”左右命之跪。敞大骂曰：“汝非我毛姻家仆耶？提溺器时，谁为汝跪？”定南大怒，厉声曰：“余大圣人之后也。”敞曰：“汝等已为虏，辱侮先圣，罪当死。”定南气咽，直前批其颊。旁武士或牵项，或以刀背折足，强作跪状。敞大骂，不屈。牵去，将斩之。式耜正色叱曰：“张司马国之大臣，不得无礼。死则吾同死。”定南素重留守，悚然遂止。因曰：“某年二十起兵海上，横行山东，南面称孤。后为清将，赐号称王，拥众数万，任以南方之事。富贵如此。公今日降，明日亦然。《语》曰：‘识时务者呼为俊杰’。清自甲申乘闯贼之变，躏入中国，五年之间，南北一统。天时人事，意可知矣。公守一城捍天下，数年于兹，屡挫强兵，能已见于天下，尚复谁为乎？不若转祸为福，建立非常，以事明者事清，毋忧富贵。空以身膏草野，谁复知之？”式耜曰：“汝为丈夫，既不能尽忠本朝，复不能自起逐鹿，称孤未几，甘为鹰犬。俊杰固如是乎？尚得以时务富贵欺天下男子耶？本阁部无功德异能，受累朝大德，位三公，兼侯伯，常愿殚精竭力，扫荡中原。今志不就，自痛负国，虽刀锯汤镬，百死莫赎，尚蒙耻求活耶？一死足矣。毋多言。”定南知不可屈，愈欲降之。同敞叱曰：“岂有天朝大臣降者？”定南愈重之，馆两人于别所，防御甚严，而供张饮食如上宾。
式耜日与同敞赋诗，慷慨赓和。清臬司王三元、苍梧道彭旷，皆式耜里人也，定南使说以百端。不应。复进曰：“国家兴亡，何代无之？生若朝露，何自苦如此？公可剃发为僧，自当了悟。为世人所不能为，岂仅仅守拘儒之节耶？”式耜曰：“僧者，降臣之别名也。佛即圣人，圣人，人伦之至也，未识人伦，何谓了悟？”王、彭见其至诚，喟然曰：“嗟呼！此真正人。”不敢复言。
会式耜遣死士遗焦琏书，极言清兵羸弱、城中空虚状，劝琏急提兵抵桂林。且曰：“中兴大计，毋以我为念。”逻卒得之以献定南，定南大恐。
闰十一月十七日晨，请二公。式耜方食。食彻，与同敞振衣出。谓敞曰：“我两人多活四十一日，今事毕矣。”敞曰：“快哉！行也。今日获死所。”士卒皆为泣下。二公颜色不变，洋洋如平时。敞藏一白网巾于怀，至是服之，曰：“为先帝服也，将服此以见先帝。”至独秀山下，式耜指曰：“一生只爱泉石，愿死于此。”整衣冠争就刃。俱被害。日色无光，大雷冬发。远近士民皆为流涕。同被难者，旗鼓陈希贤、锦衣卫杨芳龄、家人陈祥。
先是初三日，式耜知桂必不守，遣坐营徐高赍印、谢表赴行在。道阻，匿阳朔山中，清师获之。至是亦同殉难。滇营一卒怨同敞，剜其心食之。定南怒，戮之于市。
清将马蛟麟莅杀，雅重式耜，以苇席覆之，加土其上。时给事金堡已为僧矣，上书定南，请收葬。许之。越三日，侍御姚端、式耜门下客吴江、杨艺入王邸，谋殓两公。启视留守，刃血在颈，身首不殊，面如生。两人抚之而哭，曰：“忠魂俨在，知某等殓公乎？”忽张目左右视，杨抚之曰：“次子未见耶？长公失所耶？”目犹视。端叩首曰：“吾知师心矣。天子已幸南宁，师徒大集，焦侯无恙。”目始瞑。遂具衣冠殓，浅葬两公于风洞山之旷地。姚端筑室其旁，与清凝上人守墓不去。事闻，赠式耜粤国公，谥文忠，赠同敞江陵伯，谥文烈。临难诗载在《浩气吟》。
时广州亦先四日为清平南王尚可喜所破。报至梧州，帝于十一日登舟幸浔州。勇卫提督周金汤大掠梧州。陈邦传在清远闻之，飞帆先归，邀帝于藤江，将谋劫之以为重。十二日，帝舟冲雨而过，邦传谋不及发，而百官及卤簿之舟在后者，邦传劫之于江。杀部郎潘骏观、童英、许王凤等，以帝卤簿陈列营中。帝及三宫易小舟前行。十六日，至浔州。二十八日，驻跸南宁。马吉翔、李元胤追从后至。从官稍集，饥冻无人色。括行囊并吉翔所献得四千金，散给之。
十二月，勇毅将军林时望以京营溃散空虚，捐赀招募，收集游兵数千，及是方至。戎政马吉翔所部皆失，忌时望独拥重兵，遂与庞天寿等密奏时望逗留有异志，不早图，变在肘腋。时望初至，十七日早，矫命犒兵，预令健丁即演武场擒时望，以弓弦勒死。时望本黄得功偏将，貌极伟丽，胆力过人。自入行畿，保扈功最著。虽骄悍如郝永忠等，皆严惮之。时望被害，于是禁旅无人。
永历五年（清顺治八年）辛卯正月乙酉朔，帝在南宁，行殿受朝贺。十日，祀太庙。谕东阁大学士文安之督师经略楚、豫，赐上方剑，便宜行事。时赵印选率兵入行在，鼓噪拔饷，搜括宫中簪珥及布帛ブ褥绵絮等物而去。二月，孙可望遣伪将军贺九仪、总兵朱养忠、张明志、张胜等率兵入卫南宁。初，以冀王封可望，终以不允秦封，切齿朝士。监军杨畏知曰：“秦固美号，然假何如真？”可望不悦。李定国等亦劝可望趣畏知行以终始之。畏知行未至，可望已遣贺九仪等至南宁，求阻秦封者而甘心焉。九仪朝见后，使人盗杀杨鼎和于昆仑关，即舟中杀阁部严起恒，投尸于水，随杀兵科张载述、刘克珍、吴霖等于各署。朝臣惶怖。庞天寿、马吉翔叩请之，九仪曰：“前者国主请封，此数人实阻之，故奉令来杀之耳。”天寿等具以邦传擅封、今已改造册宝、赍颁前去告之，九仪唯唯而退。起恒死三日，有渔者报云：“江中有浮尸顺流至，一大虎入水负之入山，以爪掊土，方事葬埋。”时贺九仪在司礼监署，闻之，遣人往视。虎尚在旁，墓已成矣。虎见人，乃摇尾缓行去。九仪亦为惊叹。杨畏知入朝。诏进东阁大学士，入直办事。畏知，陕西宝鸡人，举乡试第一。崇祯庚辰，以保举特用，历官南金沧道。好言王霸之略，故为可望所重。及朝行在，帝以孙氏故，引之内阁。畏知疏辞再三，不允。九仪谮之可望，遂疑其贰心于己。
三月，三宫上田州。
二十五日，贺九仪修行宫，为帝驻跸。
是月，遣使偕贺九仪赍补秦王金册于可望。可望大喜，远迎拜受。随遣伪中书杨惺先奉表称谢，略云：“秦王臣朝宗望阙奏谢。臣自入滇以来，纪年而不纪号，称帅而不称王，正欲留此大宝，以待陛下之中兴。此臣耿耿孤忠，矢之天日者也。”诸臣得疏，额手相庆。
四月十二日，太后王氏崩于田州。十四日，讣闻。十七日，成服。二十三日，奉安灵舆于慈宁宫。丧礼以日易月。
先是庚寅十月，式耜遣孙检讨昌文入行在，辞世袭临桂伯爵印，且陈桂林不可守状。闻警，辞朝，同巡抚鲁可藻、御史朱田麟间道而上，阻山中。至是月，为叛将王陈策扶之以出，至梧州。大学士方以智为僧在大雄寺，闻昌文将至，谓清将马蛟麟曰：“瞿阁部精忠，今古无两。其长孙来，汝能以德绥之，义声重于天下矣。”蛟麟以为然，厚遇之。浙人魏元翼，式耜以墨吏黜之，迁怒昌文，谮于清将，执之至桂，将甘心焉。未至一日，元翼家中铁索铿然，绕室有声。元翼伏地请罪。忽吴语曰：“汝不忠不义，乃欲杀余孙耶？”元翼叩头乞缓三日，少毕家事。又忽楚语曰：“此不义奴，速杀之，奚问焉？”九窍流血而死。定南王疾，遣将祷于城隍神，恍忽见宫詹司马四大字，入殿见司马俨然南面。大惊，拜归以告。定南骇甚，供双忠神位于铁佛寺。而昌文适至，定南因厚礼之。昌文遂迁留守柩于明月洞。清凝亦迁司马之柩与夫人合葬焉。司马无子，女适兵部主事吴重义。清凝改葬之晨，而重义夫妇适至。清凝者，阳羡人，不谈禅、能急人难。入粤西，式耜爱而礼之。桂陷，清凝在昭平，同式耜次子玄锖崎岖赴难。走至永安州，遇兵，玄钅育失于路，清凝仓猝入桂林，而留守已殁。玄锖自庚寅三月航海觐亲，备尝艰苦，至十月始至粤西。万里寻亲，不获一见。哀哉！后玄锖或云已死，或云入滇，不知所终。
五月，孙可望谕九仪械畏知还滇。可望怒叱曰：“遣尔至粤，所行何事？且尔做内阁耶？”畏知曰：“此由圣恩。畏知三疏力辞，不蒙俞允。业已报闻久矣。”可望曰：“果尔，即宜潜还本国，尔宁做得内阁耶？”畏知愤然曰：“殿下已归正，遣畏知请驾。畏知在朝，乃欲为殿下行尊周盛事。假令畏知不可为内阁，殿下何以独可为秦王乎？”可望大怒，命从军法，欲胁之使改，逆知必有谏者。畏知昂首即出。时安西、抚南等咸在旁，谓可望曰：“我等欲行大事，如此人尚须留下。”可望即谕传宣：“且留他死。”而畏知已戮矣。可望恨曰：“杨公死，我桓文事不成矣。”
是月十八日，敕鸿胪寺曰：“顷以忧戚之中，不遑亲政。今值服除，当面与辅臣商决政事，兼行日讲。该寺即传工部修中极殿。翰林院举堪日讲记注员名，以二十七日举行。”
六月，帝患足痛。
七月十五日，中元，遥祭祖陵。十八日，葬太后于两江之宋村山，谥孝正。
九月，陈邦传叛降于清定南王。南宁震恐，帝议移跸，人心惶惶。庞天寿、马吉翔素与贺九仪有成约，力排众议，坚请向黔。
十月，九仪入朝，谓廷臣曰：“昔秦王为请移跸滇、黔，特命我扈驾。今诸臣既各疑贰，我岂能担此重任乎？”遂撤营去。帝遣官赍留。不应。
十一月，南阳侯李元胤疏请航海。不允。
十二月，初十日，帝至濑湍而南宁陷。太仆寺少卿丁元相、户部员外郎杨尚甸死之。开国公赵印选报清师已过新宁州，从陆路追袭，仅隔百余里。于是君臣悉登陆，焚舟楫，踉跄失次，扈跸官员相失。皇嫂桂恭王妃亦不能相顾而弃之。十一日，帝由土司入黔境，至逻江界已三十余里。清帅线国安以精兵追蹑于后。尘掩其舆，群臣相顾失色。国安行次，遇白发老人，问曰：“永历何往？汝见之乎？”答曰：“见逻江土官迎驾入土司矣。”又曰：“去此几何？”答曰：“止半日程。但山峻路狭，恐大马难行。”言已，遂入深篁中。国安视西日就山，即令驻营。协镇马雄趋进曰：“永历相去不过三十里，何以不追？”国安曰：“我奉令取南宁，未闻令进土司也。若连夜追袭，或有疏失，谁任其咎？”雄闻唯唯。遂同还南宁。次日，乡民以闻，云清兵已回，上下稍安。及过逻江，猝遇可望所遣总兵高文贵、陈国能、狄三品等讨皈朝叛夷，方还师，乃相率扈跸。可望致书从官曰：“南宁不守，当走安隆。”从之。
是冬，宋国柱、杨奇扈从入滇，舟覆溺海中死。卒如张鸣凤之梦云。
永历六年（清顺治九年）壬辰正月癸酉朔，帝野次。三日，至皈朝。十一日，发皈朝。十二日，次富川。十三日，次沙斗，十四日，次西洋江。十五日，次宝月关。
十六日，至广南。孙可望遣总兵王爱秀迎驾，上言：“臣以行在孤处僻粤，再次迎请，未奉允行。然预虑圣驾必有移幸之日，所以先遣各营兵马肃清夷氛，道路无碍。广南虽云内地，界邻交趾，尚恐夷情叵测。臣再思维，唯安隆所（隶贵州晋安县）滇、黔、粤三省会区，城郭坚固，行宫修葺。一切粮储，可以朝发夕至。莫此为宜。”帝允之。
二十五日，发广南，次童卜。二十六日，次晒和。二十七日，次鼎贵。二十八日，次加浦。二十九日，次那年。三十日，次侄堂。二月癸卯朔，次呼马。二日，次扁牙。三日，次板屯。四日，次板桥。五日，次峒沙。六日，至安隆所。可望遣总兵张胜屯兵安隆城外，来谒，请易安隆所为安龙府。又遣督捕张应科为总理提督，实用以阴制帝也。凌逼百端，无复人臣礼。其疏辞云：“人或谓臣欲挟天子令诸侯，不知彼时尚有诸侯，诸侯亦尚知有天子。今天子已不能自令，臣更挟天子之令以令于何地？令于何人？”
九日，遣太常寺少卿吴之俊赍玺书至滇。
三月，可望欲入安龙陛见。伪兵部任馔进曰：“国主欲入安龙，恐二龙不便相见。”可望遂止。馔博学能文，尤善太乙六壬。常语人曰：“明运已终，事无可为矣。”曾具启劝进，称为国主，设六卿，铸兴朝通宝，以干支纪年，可望昵之。故闻言遂止。惟谕令应科奏报，每年进膳羞银二千两、米六百石于府仓库支给开报而已。于是伪知府范应旭直署于簿曰：“皇帝一员，后妃几口，月支银米若干。”可望见之，恬不为异。
帝日居宫中，一筹莫展。从宫纷纷告艰请俸，则悉搜所用金银器皿销毁济之。或所给银米已至，即用以呼卢取快，否则灌园怡情，不复计军国一事。四月，清平西王吴三桂由汉中统兵入四川。可望守将白文选走回南。定南王孔有德自广西以七百骑出河池州向黔，大军驻柳州接应。可望使李定国与冯双礼由黎平出靖州，马进忠由镇远出沅州，会于武冈，以图桂林，步骑八万。刘文秀与张先璧由永宁取叙州，白文选由遵义取重庆，会于嘉定，以图成都，步骑五万。疏闻安龙，封定国西宁王，文秀南康王，余各加公侯。从可望请也。
是月，南阳侯李元胤往海南招集散亡，至钦州之防城，为土兵王胜堂所执。绝粒九日。送靖南王，不屈。左右梃下，元胤笑曰：“鼎镬不惧，何有于梃？”又令作书招琼州杜永和，元胤曰：“杜将军缮兵穷海，差有丈夫气。乃招之耶。”靖南义之，使其故人往说之曰：“将军昔未受国恩耶？”元胤大恸曰：“某昔者不过帅府一亲人耳。今爵通侯，司禁旅，狼狈被擒，计惟一死报国。豫让不言之在前乎？吾父俟于九泉久矣。”故人曰：“李果将军父耶？”元胤曰：“岐阳、黔宁俱以养子自奋。子毋多言。”遂与弟建捷及前锋将李朝用俱被害。
五月，定国等进攻靖、沅、武冈，皆下之。定南王还守桂林。定国由西延大埠疾趋广西，败清师于严关。严关者，所由入桂林要道也。
七月四日，定国率诸军克桂林。定南奔入营中，怅然无一言，久之，曰：“已矣。”其妻曰：“勿虑我不死。”乃嘱一妪携其子出避，曰：“苟得免，度为沙弥。勿效乃父作贼一生，下场有今日耳。”遂自缢。定南赴火死。俘叛将陈邦传并其子曾禹送贵州，杀之。获定南一子，平西王婿也，因留于营。
刘文秀克叙州，白文选克重庆，平西王等回兵保宁。文秀由嘉定成都追至保宁。讨虏将军王复臣曰：“不可，我师骄矣，而彼方致死，以骄兵当死寇，能无失乎？”诸军皆不以为然。张先璧军其西南。先璧号黑神，军容耀日，然未经大敌。三桂登城望之曰：“独是军可袭。”乃出精骑犯其垒，果惊溃。转战而南。复臣手斩数人，环之者益众。乃曰：“大丈夫不生擒名王，岂可为敌所辱？”遂以刀自刭。清师皆惊叹以为烈士。文秀撤围而退。三桂不敢追，曰：“生平未见如此劲敌，特欠一著耳。”盖如复臣所云也。
报至滇，可望下令曰：“不听谋，损大将，刘抚南罪应诛。念有复城功，罢其职，闲住。”文秀归南。
九月，李定国北取衡州。自南宁既败，胡一清、赵印选、马宝、曹志建等尚留粤西，屯聚山谷间。定国至，皆相率来归。民间亦多啸聚以应者。声势大振。孙可望亦自至沅州，使白文选、张虎攻辰州，下之，杀清总兵徐勇。长、岳相继奔溃。而清敬谨王率兵南下，十一月，遇定国于衡州，相持匝月。定国密令冯双礼率兵伏永州小路，而亲率所部决战。佯败至宝庆，复还奋击，伏兵起而夹攻。敬谨王大败。后得盔号，始知敬谨王亦死于乱军中。定国退屯武冈。
可望杀陈邦传，剥皮传尸至行在。大书于牌曰：“逆犯陈邦传，先经肆劫皇扛，镖掠宫人，罪已漏网。不思建功赎罪，辄行背主反叛。今已拿获，解赴军前，立将邦传父子剥皮，传示滇黔。”云云。绝无奏报之疏，遣人递送安龙即去。御史李如月疏劾孙可望擅杀，无人臣礼；邦传宜加恶谥，以惩其逆。疏上，留中。召如月入朝，面诘云：“谥法乃褒奖忠良字样，从无恶谥之例。尔小臣何得越典妄言？著革了职，于午门外廷杖四十。”张应科即入朝看科抄，科臣以本留中告，应科遂往如月署，索其疏稿。如月笑云：“何须用稿，自有揭帖，明早发来。”既而果遣人以揭帖投应科署云：大明山东道御史揭帖递至伪营提塘当官开拆。应科大怒，驰报可望。可望得报，即令应科杀如月，剥皮示众。乃缚如月至朝门，应科捧可望令旨，喝如月跪。如月叱曰：“我是朝廷命官，岂跪贼令？”乃步至中门，向阙再拜，大哭曰：“太祖高皇帝，我皇朝从此无谏臣矣。奸贼孙可望，汝死期不远。我死立千古之芳名，汝死遗万年之贼号，孰得孰失？”应科促令仆地，剖脊及臀。如月大呼云：“死得快活，浑身清凉。”又呼可望名大骂不绝口。及断手足，转前胸，犹微声恨骂，至颈绝而止。
时行宫湫隘，内监宫人非轮班入直者，皆居朝外。有宫人夏良璞者，年十九，聪敏殊丽，能诗，工真、草书，驰马试剑，皆绝技也。时居西城。应科朝罢过之，见良璞方据案作书，心动，即令民家妇出入通殷勤。又廉知良璞与巴东王妃结姊妹，常往来王第。应科所居适相对，遂馈遗巴东，交契甚密。王妃常出见，应科以嫂呼之。渐以良璞情事告，妃为诱致良璞通焉。后良璞昼入王第，夜宿应科署，益无忌惮。有密启司礼监者，遂以上闻。执良璞考讯，具得实。发内官杖毙。以内监知情不举，同杖死。赐巴东王及妃皆自缢。应科大怒。既而知庞司礼奏报，凌晨率数十人至司礼署，怒问天寿曰：“夏宫人有何罪过而致之死？”天寿曰：“此官家事，与卿何预？”应科语塞，手按其刃拟甘心于天寿者三。见有备，不敢动。已而马吉翔至，解之，乃密遣戎标参将张隆赍玺书，以良璞致死事告可望。可望已先得应科密报矣，谓张隆曰：“朝廷何苦因一宫人杀多命，孤当遣人去处应科，尔可同回。”其明日，传宣王爱秀同隆还，即以爱秀代应科，而令杖应科于朝门外，革其官，押解至黔。未几，委任如故。
永历七年（清顺治十年）癸巳正月戊辰朔，帝在安龙。
封李定国西宁郡王。定国自桂林胜后，不复禀可望约束。冯双礼与争卤获金帛，遂回黔，谮于可望。可望连发令箭调还，密令双礼总统，而以伪都督关有才等潜师蹑其后。有龚铭者，为定国中书，使黔，闻其事，即驰书间道密白定国。时讹言繁兴，有传定国滋不悦者，曰：“我奈何受郡王封？当亦如国主。”有传诸营偶语者，曰：“秦王下长沙，即改年号，受禅让矣。”及废处刘文秀，咸曰：“大功未行厚赏，偶败则膺严罚，我等如何苦捐身命？”又以杀杨畏知故，内外咸怨。是月，可望出师，慨然经略中原。其封定国诏使已出黔境，复追还之，曰：“孤今出师入楚，当面会安西，大庆宴，亲奉上敕以光宠之。”而众益交相论叹，以为此真项羽之元刂印吝封赏也。至有为定国虑者，曰：“此伪游云梦计耳。”当是时，定国已统兵过左江，克复柳州、庆远、南宁、太平诸城，而可望所遣令箭，一日三至。定国因涕泣谓其下曰：“不幸少陷军中，备尝险阻，思欲立尺寸功，匡扶王室，垂名不朽。今甫得斩名王，奏大捷，而猜疑四起。且我与刘抚南同起河南，战功具在。一旦诖误辄废弃，于我忌害，当必尤甚。我妻子俱在南，我岂得已而奔哉？”将欲还师。俄得龚铭密报，知双礼等追兵将至，即遣精兵伏柳州江口芦荻中，俟双礼过迁江来宾二邑间，方逆之。双礼败回，伏发，一军皆陷，悉投江中。定国令纵双礼、有才还，易旗帜以诛逆为名，移师柳州，声言东下。可望闻，怅然久之。欲止军东下，然业已督师在道。又信其军士言：“敌殊易杀。亲履行间，立大功以服众心耳。”谍知敌屯回路江，遂欲袭击破之。令于军中曰：“凡获敌马者悉给之。时方四月，阴雨延连，行三日至回路江。敌惊欲溃。南军殊易之，甫斩数人，便掠其马。敌睨军乱，还南搏战。南军溃。清师鉴衡州之失，亦不追，遂各引还。而李定国于是遂据有广西。
行在闻之，君臣庆幸。计欲通好安西，密与内监张福禄、全为国、内阁吴贞毓、内翰蒋乾昌、李元开、御史李颀、周允吉、朱议昶、武安侯郑永元、大仆少卿赵赓禹、郎中张镌、蔡缤、朱东旦、中书易土佳、任斗虚、太常博士胡士瑞等谋。以马吉翔、庞天寿素党可望，秘不令闻。
八月，遣马吉翔往南宁省陵。既行，而贞毓等始撰敕及祷屏翰亲臣金章，以赐定国，许封晋王。
九月，遣主事林青阳、孔目周官，由间道趋柳州。
十月，青阳等至柳州，定国率官军郊迎。受读感激，泣数行下，军中皆流涕。遇青阳等有加礼焉。且云：“因系密敕，未敢复奏。俟恢复东粤，即来迎驾。”有刘议新者，自行营回，过南宁，为马吉翔言其状。吉翔虽赴南宁，留其弟雄飞在安龙觇动静。乍闻议新言，大惊曰：“不早自为地，事发，祸且及我辈矣。”阴使提塘王爱秀报可望。可望大怒，使人邀青阳，周官执之。并执马吉翔赴黔以待对理，阴厚待之。
是年，清师破广州，杜永和降。
永历八年（清顺治十一年）甲午正月壬辰朔，帝在南。改南为兴龙府。可望遣伪指挥郑国至行在，言定国私通奸臣，要胁封爵，今使者已被执供明，乞查发同谋者付之，以报国主。帝谕曰：“事非内人所敢为。假敕假宝，外间多矣。”国怒而出，质之诸臣，皆曰不知。国曰：“有金章密旨差官姓名，岂同风影？”朝臣佯应曰：“是必文安侯马吉翔奉命谒陵，或携有先年视师空敕，因而填发，未可知也。”国即南去，械吉翔还朝面讯。吉翔力辨。于是职方司郎中张镌、御史周允吉、吏科徐吉应之曰：“此系我等所为。因我君臣性命悬于贼子之手，惟有藉安西一人，或可得延朱家国祚。今既事败，天也。生不能戮力王廷，死当为厉鬼以杀奸逆，奈何箝口以贻主上忧乎？”乃供同谋者吴贞毓等一十八人。国按名执禁，令锦衣卫康永宁会同严讯，备极五刑。因问谁为敕稿？镌曰：“我为之。”允吉曰：“改定者，我也。”问何由得宝？张福禄曰：“我为尚宝，宝由我盗用。”国曰：“此事必有主使。”盖意在连及帝也。遂复加毒楚。镌曰：“果有主使者。”国问为谁？镌厉声曰：“主使者，逆贼孙可望也。”国怒骂之。镌亦大骂。十八人皆同声不屈。既讯，以报可望。可望令磔张镌、张福禄、全为国三人，余俱斩。帝谕郑国，贞毓以辅臣处绞。镌等临刑犹从容入慰主上，挺然就戮，颜色不变。共相谓曰：“我等死后不可分离，须戮力同心，活擒秦逆，献之阙下。”因向阙拜而就死。吴贞毓绝命诗曰：“九世承恩未尽酬，忧时惆怅乏良谋。魂迷故国长依汉，梦绕高堂愧报刘（贞毓祖母，百岁尚在）。忠孝两穷嗟百折，匡扶有志藉同仇。击奸未破朱Г额，空竭丹心报国仇。”李元开诗曰：“忧愤呼天洒酒卮，六年心事恋王畿。生前痛为忠奸辨，身后宁知仆立碑。报国痴心终不死，还家春梦已无期。汨罗江上逢人语，惭愧无能续楚词。”蒋乾昌诗曰：“天地从来不可欺，寸心肯许世人知。奸臣误国非常惨，志士成仁自大悲。辛苦十年今已矣，间关千里竟何之？孤魂飘渺从风去，化作山河壮帝畿。”胡士瑞诗曰：“抚景千年恨，扪心一片丹。太阿柄已失，巢覆卵无完。夜雨青磷暗，秋风白骨寒。彼苍如可叩，封事死犹弹。”朱议昶有“精忠贯日吞河岳，傲骨凌霜砥浪涛”之句。余皆不传。安隆人哀之，后为祠以祀，称十八先生。
可望谕南城守伪固原侯王尚礼，令籍定国宫眷并文武兵丁妇女，欲分配各营。尚礼虑大营分散，将滋内乱，乃三启止之。惟汰安西大营粮饷。尚礼遣女使馈茶果于王妃，实皆金银也。安西大营，赖是得济。
六月，孙可望自黔还滇，急谋僭号。及期，冕小不可冠。自辰及午后大雨，震雷交作。可望不怿而止，遂还贵州。
八月，可望设科取士，以慧光寺为贡院，取中陈士基等五十四人。
是月，定国破广东高州府，雷、连亦下。
永历九年（清顺治十二年）乙未正月丙戌朔，帝在兴龙府。
可望遣兵犯常德，败归。
秋，定国帅师围新会。
永历十年（清顺治十三年）丙申正月庚辰朔，帝在兴龙府。
时清平南王尚可喜率大兵救新会，击定国，败之。定国率残兵数千奔回南宁，标下高文贵、靳统武亦次第奔回。南宁驻镇不知虚实，奔黔告可望，谓定国将席卷而东。可望大惊，恐定国直入安龙，即调镇国刘启明等十三营，遣关有才统之，以拒定国。使白文选赴安龙促帝移黔。帝母子闻之哭。从官亦哭。白文选亦心非其所为，对之心动，因以情告曰：“姑缓行，俟西府至，可无危矣。”遂以舆徒不集报可望，阴以留俟定国。定国兼程疾进，先遣参将杨祥诈为营卒，诣行在，谒司礼庞天寿，于衣甲后心出密疏，署云藩臣李定国谨奏，而钤以屏翰亲臣赐章。天寿以闻。帝阅疏云：“臣今统兵迎扈，不日即至行畿。先遣奏安，万勿轻信奸逆，辄行移跸。”云云。帝稍安，然甚秘之。
关有才等见衣甲皆皂，又有捷取字号，则以为清师从天而下，遂跨马而逃。二十一日夜半，白文选率步骑至安龙城外，大呼曰：“安西兵马即至矣，切须谨慎。”言毕，奔马而去。黎明，忽有叫门者曰：“我西府长随夏太监也。”遂令入朝面奏曰：“定国即至矣，遣臣先驰奏闻。因至冻洒箐，秦兵倒塞路，马不能前，所以少迟耳。”俄而周城炮起马嘶，声震数里，结寨遍九山头。安西率骑入朝陛见，君臣相持痛哭。帝谕曰：“久知卿忠义，恨相见之晚。”定国泣奏曰：“臣蒙陛下知遇之恩，欲取两粤以迎銮舆，乃不惟不副臣愿，且置陛下于重忧，臣万死无能自赎矣。”帝慰谕，赐坐及茶。定国还营，知文选去未远，遣夏太监等追留之。及于普平市，文选乃还，随定国入朝，密计幸滇。
二十六日，帝自安龙进次普安。遣兵守盘江，以御可望。
二月十一日，定国发前导后卫各骑卒三千，亲与白文选居中扈从，自新城普安直抵曲靖。请帝于行营安置，而亲率精兵入南。时守滇者为刘文秀与王尚礼、王自奇等。文秀亦素怨可望，闻定国至，佯与王尚礼等勒兵，私以数骑驰迓定国曰：“我辈以秦王为董卓，尤恐卓后复有曹瞒。”定国为之指天誓。
三月，定国及文秀、文选等各率所部至曲靖，扈从銮舆入滇。以定北府为行宫，暂驻跸焉。改南为滇都。赐定国晋王册宝，封文秀蜀王，文选巩国公，王尚礼保国公，王自奇夔国公，秦王扈卫张虎为淳化伯，水军都督李本高为崇信伯，高文贵广昌伯。又以定国记室金惟新为吏部侍郎，龚铭为兵部侍郎。马吉翔素党可望，知不为朝议所容，乃谄事维新及铭，为言于定国。五月得奏请，仍以文安侯入阁办事。
六月，遣白文选、张虎赍玺书还黔慰谕可望，宴辞，谕曰：“卿等往道朕意，务使两藩复敦旧好，事事为祖宗社稷起见。卿等功名垂竹帛矣。”文选等谢。往见可望，曰：“国主倘以旧好为念，不必苛求。若必欲擒之，假臣精兵二万，当立致定国于麾下。”可望以为诈，欲杀之。众救之，得免。乃夺文选所部兵并巩国公印，羁之营中，使张虎复命。然以妻子在滇，未敢显为逆也。
七月，光禄寺少卿高绩、御史邬昌期疏劾马吉翔、庞天寿以谗邪专擅，二藩与之友善，恐滋奸弊，复蹈可望故辙。疏上，两藩闻而不朝。帝以绩等妄言，谕廷杖革职。安西中书金维新趋渭定国曰：“绩与昌期罪固当死，而藩主则不宜留杀谏臣之名。”定国悟，驰救之，至则绩已死，而昌期得复原官。
八月，晋王李定国奏请归秦王宫眷，遣张虎护送至黔。定国亲饯之郊外。
十一日，移跸秦王宫，即南府城中五华山地也。山有五华寺，为滇南诸刹之冠。于是初莅朝堂，二王侍立，文武肃然。朝贺出，皆喜相谓曰：“今日乃见真圣主也。”是日，帝为二王割襟，订二姓之盟。二王谢恩感悦。先是，定国有龙骧、天威二营，既出粤，祁三统龙骧营留蜀。可望令镇遵义。及定国入滇，调三，而可望亦使人调之。三谓其所部曰：“国主安西，旧主义均。今安西尊帝为民主，名正言顺，我等亦有所依，当遵西府之调为正。”众皆诺。于是却秦使，整旅还滇。可望遣兵追袭。三且战且走，辎重尽失。十月达行在。朝贺毕，即命封咸宁伯以旌忠正。
永历十一年（清顺治十四年）丁酉正月甲辰朔，帝在滇都。
可望遣伪臣程万里请大营及旧标还黔，许之。仍给夫马以送。
二月，起用先朝礼部尚书雷跃龙入阁办事。跃龙为可望所宠任，时告假在滇，故特起之。庞天寿以秦党自疑，惧晋王害之，忧愤病卒。赠恤甚隆，葬省城之华亭寺前。命太监李国泰掌司礼监事。
三月，以伪户部龚彝仍掌部事。彝以进士为先朝侍郎，可望任为户部者也。彝乃辞曰：“臣受秦王十年知遇，未有所报，安敢拜新命乎？”晋、蜀劾奏曰：“龚彝止知秦王十年之恩，独不念祖宗父子受国家三百载之恩乎？”有诏议处。彝伏阙免冠谢罪。降印局大使。数月，仍还原官。
初，可望在滇，伪兵部任馔屡表劝进。时馔已死，定国追论其谄逆。诏掘馔尸戮于市，籍其家，子孙俱遣边远充军。
四月，舟山监国鲁王遣总兵何达武赍表请会兵出吴、楚。
王自奇反于楚雄，率张明志、关有才二镇营兵西上永昌。
八月，举南乡试，以演武场为贡院，取中王肇兴等五十四人。
可望自定国入滇，久谋内犯，畏定国兵强不敢骤发。因程万里奏请大营回黔，具以滇兵单将弱告可望。又诸镇自楚、粤至者皆聚于黔，所部甚众。遂大举犯阙。然人心多不直可望。马进忠、马惟兴、马宝以同姓相密，又与文选交，阴谋助定国，从容为可望言：“文选心膂旧人，诸将才望无出其右者，特前为定国所胁，使其心果向外，必不敢复来。今来而夺其兵，失归向心。试重用之，必能为国尽力。”可望信之，乃以文选为征逆招讨大将军，总统诸将前行。自率大军而进。留冯双礼守贵州。马进忠以病留安顺。可望令预造丑锁三百具，曰：“破滇之日，械送行在君臣也。”双礼力谏不听。及送师于郊，又谏曰：“国主往而果胜，难免犯阙之名。若其不济，则黔非国主有矣。”可望叱去。双礼痛哭而回。及师行在途，雨水泞泥，马多倒毙。抵交水，定国以沐天波、王尚礼、靳统武留守扈从，而亲与文秀督各镇兵御之。帝御五凤楼宴饯，簪花犒赏三军。时久雨忽霁，人心踊跃。
王尚礼素有异志。天波、统武精严城守，召尚礼入朝，悉收其兵器，以兵守之。天波素善流星锤，经乱每携袖中。是日恐左右有变，出锤舞，纵横掷击。尚礼俯首叹曰：“吾已为槛中虎，不复烦公攘臂也。”
九月朔，定国等兵至曲靖，屯于三岔。与可望接战，连北，退守曲靖，坚壁不出。
十四日，文选抵交水，距三岔二十里，轻骑奔定国军，且言人心内向，可一战走也。可望闻变欲还。马宝佯为切齿曰：“吾乃为跛贼所欺，要当手缚之，生食其肉。且一人去，何足重轻而废大事耶？”文选前为贼时，尝战伤足，医者生截他人足以接之。虽愈而跛，故宝呼跛贼云。可望乃止，曰：“两酋齐出，会城必虚。”因使马宝、张胜、武大定间道袭南。
十八日，鄂国公马进忠密遣人报定国曰：“可望已使张胜等统锐卒三千袭南矣。公可坐而待毙乎？”定国遂传令三鼓蓐食，五鼓发兵，攻之。可望大败，溃走白水。所随不及三百人，皆传宣官校。余悉陷没。于是急问左右马国公曰：“总总安在？”众应曰：“未败之先，白、马二营已归晋寨矣。”可望始大悔恨，曰：“冯双礼阻我兴师而坚不听，天亡我也。且仙台老僧能前知，尝问以出师凶吉，曰：‘惟不令白马相随，可无咎也。’初谓白马有碍于师行，既悉除不用，岂意其为进忠、文选乎？”因仰天大哭。复遇淋雨。既又谓其众曰：“昔年有石碑出水，镌文云‘来是观音面，去是老僧头，’由今推之，天意欲令我去发归清也。定国不世之仇，定须报复，我又岂惜此数茎头毛乎？”于是决计归清。
可望方奔回，而李本高率数十骑追及之，引枪刺可望，过马首。可望大喝曰：“本高非孤旧人耶？受恩深矣，乃来杀主乎？”本高应声曰：“既做朝廷官，便须知君臣大义。本高非杀主，乃来杀欺主贼臣耳。”言未既，为流矢所中。可望得脱。余众相率尽降。
定国既败可望，腾露布奏捷。虑会城有失，使文秀、文选东追可望，自引兵还救根本。
二十一日，张胜、马宝等潜师至滇，欲入城。守者误以为捷师先还也，不为意，谛视衣甲皆非，遂急闭城。已有二骑突入，获之。张胜大呼王尚礼开门，至数十声，无应者，乃退。过三市街，已昏时矣。见金马坊垂布丈余，执居民讯之，告曰：“此晋王杀败秦王之露布也。”胜复令人读其辞，乃知可望于十九日兵败而逃。顿足叹曰：“大事休矣。”即纵兵焚掠。至横水塘，定国回师，遇之。马宝跪迎于道。张胜接战竟日，杀伤各千余人。张胜见势不敌，败走至亦佐县山谷中，馁甚，求食不得。逻卒获之以献。磔于市。
王尚礼知可望败走，忧惧不知所出，遂仰药死。帝犹令部议加赠恤，予祭葬，赐茔东门外。
定国凯旋，诸臣郊迎，入朝庆贺。复至晋第启贺。刘文秀获张虎于西水，械送滇都，系狱。
可望奔还贵州，夜半入郭，方与冯双礼相持而哭，忽闻城外炮声三。城中惊窜。盖双礼欲讠术之，密令本营起炮以速可望之行。可望遂挈家口辎重走镇远。文臣惟杨惺先，武弁则康国臣、郑国、张应科、叶应祯等，皆稔恶不容于滇、黔者，故偕可望远遁。及至楚南，遣惺先前往长沙，赴清经略洪承畴军前，通款投降。双礼断后，掩其子女玉帛，同文秀、文选归南。
初，缙绅附可望，劝进者累累。可望败后，滇人以诗讥之，其末云：“秦宫火后收图籍，犹见君家劝进书。”
十月，定国率师讨王自奇于永昌，遣人招之。不从，令关有才逆战。定国阵擒之。自奇败走腾越，势穷自刎。张明志自诉被胁，请收集溃兵自赎。定国既定迤西，遂班师，奏请行赏。封白文选巩昌王，马进忠汉阳王。进忠为闯营降将，所谓混十万者也，封后旋卒。又封冯双礼庆阳王，马宝淮国公，马惟兴叙国公，靳统武平阳侯，祁三咸宁侯，高文贵广昌侯。磔张虎、关有才于市。军民大悦。
时镇将俱升赏进爵，惟沐天波辞曰：“吾世受国恩，常虑无以报，宁敢望新秩乎？”盖久知国势已去，自分身殉，使其子分赘于各土司，曰：“庶存先人之祀于万一。”
是冬，议开缅甸为省，以元江上府为总督。不果。
永历十二年（清顺治十五年）戊戌正月戊戌朔，帝在滇都。
遣使赍玺书从安南出海，封郑成功为延平王，授张煌言兵部左侍郎，其余除授有差。徐孚远随使入觐。
始，刘文秀追可望，获其马骑一，自云“曾为可望内使，在滇时，奉令密窖银两金犁于内殿。昨令臣随行者，为虑臣起窖也。今既败去，愿首报以为兴王之资”。文秀遂率之还滇，奏之。命俟晋、蜀二王面同起窖。及是，果获窖银二十九万两，金犁一，重五百两，于后宫石台下。二王奏留供御用。帝谕二王以济军饷。
是月，可望入北京。清封义王。献滇、黔图，险阻、设伏、曲折皆备。
二月，赐前滇黔总制范矿赠恤。初，矿驻贵州，可望入滇，遣定国与之盟，言共扶王室。矿开陈大义，且曰：“假令可望渝盟，奈何？”又笑曰：“扶明，我则奉之。渝盟，我则杀之。”及定国入粤西，可望凌逼君上，矿以忧愤死。帝追悼之，故有是命。并赐故辅严起恒、杨畏知及张载述、刘熹尧、吴霖等五臣赠恤。
又，可望杀吴贞毓等于安龙北关。至是，令部议加原衔三级，予谥赠恤。立牌于马场，表其地曰十八先生成仁之处。
四月，刘文秀痈发于背。帝临问。定国亦率医责治。疾笃，上遗表云：“敌兵日逼，国势日危。臣请入蜀，就十三家之众，出营陕、洛，庶几转败为功。”云云。帝嘉之。及卒，命以亲王恤之。文秀仪度温雅，柔和谨慎。入滇之初，曾屠武定。既而悔之，自是不妄杀一人。
先是有西安人贾自明，自言识天文、地理、阴阳、象纬、遁甲之事，兼能制木牛流马火攻器具，又驱遣风雷诸术。常往来秦中各山，图集义旅。未就。因见王气在滇、黔间，变服至贵州。文秀一见，以为异人。既而文秀病，因见定国。定国大喜，疏荐之。朝命为雷击将军。试其火器，殊效。又制遮牌挡木，行营用之，周匝连环，屹如长城。乃遍取铁工木工，征求夫役。自明亦自尊大，遇朝士不为意。靳统武遣人阴杀之。其后果有知自明为洪承畴所遣、为缓兵之策者，以告定国。定国讳焉。
文秀既卒，定国以蜀自益，委朝政于龚铭、金维新，乃派兵加饷，卖官鬻爵。旧人怨叛，边警日迫。定国不及觉也。
是月，孙可望统楚、蜀、粤三路兵规取滇、黔。报至行畿，上下震恐。定国虑可望熟识险隘，而各汛守皆可望旧人，悉更调之。使其将刘正国、杨武守三坡、红关诸险要，防蜀；使马进忠等驻贵州。而蜀兵至三坡，正国奔回南。晦日，克遵义。楚兵自镇远抵黔，马进忠等亦走。
五月，清师获黔抚冷孟饪，洪承畴待以宾礼，曰：“公若归诚，当仍用抚黔。”孟饪曰：“宁为明鬼闻香，不作叛人遗臭。”乃送觉罗贝勒军前，亦以甘言招之。孟饪不为屈膝。强之再，终不屈，乃押赴市。孟饪挺然直立，遂解其尸。报闻，咸为悲悼。遣兵侍程源、文安侯马吉翔谕祭，赠兵部尚书，荫其子冷之旭世袭锦衣卫佥事。
蜀兵败杨武于开州之倒流水。
六月，定国上表出师，自任当黔路，移镇安顺。以白文选任川路，移镇七星关。发夫运粮，天雨泥深，挽负不前辄鞭之至死。冤号载道矣。
七月，蜀兵抵独山州。
八月，定国率勋镇出师。帝御五凤楼宴饯。未及簪挂，大雨忽注。军士散走，无复行次，咸相谓曰：“此番师行，浑不似征可望时也。”定国陛辞后，阻雨不前。日行仅二三十里。人心惶惑。至关岭，刑牲祭汉前将军祠。定国沥酒誓曰：“定国奉命兴师，不以此身殉社稷、佐中兴者，神威当截其头。”顾谓诸将曰：“诸公皆受国恩，可不于神前各明忠赤乎？”于是诸将皆跪告于神曰：“某等有不与晋殿下戮力同心、报君父之恩者，神明殛之。”既盟而饮。还营，定国大悦。十月，清师至贵州。冯双礼连疏请援。定国欲即进兵，俄得洪承畴书，略曰：“某本待罪先朝，志切同舟。惟候吴王之至，即当会兵以听指挥，无烦王师远出也。”定国信之，遂缓师。而清师由水西泗城并川中三道而入。报至，定国始悔，急整兵御之。过安龙，与清师连战，未分胜负。忽传清师前导为可望扈卫康国臣，定国虑军中将士多可望旧人，变或中起，且举炮为回风激还，本营溃乱。定国急奔还行在。勋镇俱散。
十二月，蜀出遵义趋乌撒。白文选惧，弃七星关，走回沾益。
初六日，定国微服入行在，密奏移跸。敕沐天波宣谕缅甸，发官旗，沿途征兵，开路迎扈。诸臣俱议束装，独行人司任国玺疏请留滇，曰：“君为社稷死，臣为君父死，何往焉？”下其议，皆曰：“卷土重来，再图恢复，天意未可知也。君臣死社稷，尚非其时，何遽出此？”疏遂留中。
十三日，定国谕民避兵，云：“本藩在滇多年，与尔人民，情均父子。今国事颠危，朝廷移跸，势难同尔等偕行。恐清兵一至，杀掠淫污，猝难逃避，尔等宜乘本藩未行时，各速远避，毋致自误贻戚。”于是城内外哭声鼎沸，携负狼奔。时已征贮秋粮，定国谕各营不得焚烧仓廪，恐清师至此无粮，徒苦我百姓。或曰帝谕定国勿烧故云。
时清师三路会于曲靖。朝议莫知适从。有陈建者，举文秀遗表语，请入蜀。马吉翔恐蜀将夺其权，力阻之。沐天波请走迤西，地近缅甸，帝从之。
十五日黎明，发滇都，从之南者数十万人。艾能奇子承业纠狄三品劫驾，事泄。定国乃亲殿，承业遂不复追。帝至碧鸡关，兵民塞路，哭声动地。帝谕住辇，立起，手扶天波左肩，回顾城中宫阙，挥涕曰：“朕行未远，已见军民如此涂炭。以朕一人而苦万姓，诚不若还宫死社稷，以免生灵惨毒之为愈。”谕毕，大哭。天波俯伏奏慰，定国飞骑亦至，共请前发，以慰众心，帝乃就辇。间关至大理，扈从相失过半。
永历十三年（清顺治十六年）己亥正月癸巳朔，帝野次。四日，驻跸永昌，传谕罪己。李定国还黄钺待罪，自请削秩。不许。
吴三桂由广西、四川旁捣其虚，从黄草坝入滇城，兵不血刃，迤东皆定。即分兵三路追杀总兵王国勋于普氵朋驿。
吴三桂败白文选于玉龙关。定国闻败，请急渡潞江，趋磨盘山。山有石门一道，长亘五里，曲而险隘。乃设三伏，初伏窦名望，中伏高文贵，三伏王国玺，以御清师。
闰正月十五日，帝发永昌，将入缅。时文武尚四百余人，兵士数千人。工部尚书王应龙闻帝奔迤西，偕其子昼夜兼行，至永昌，而帝已前发矣。应龙孤身，不能于乱军中独行，乃谓其子曰：“我本草茅微贱，蒙恩授职，官至司空。先不能主扶社稷，今不能患难从君，尚能腼颜求活人世乎？”因自缢。其子泣曰：“父殉君难，子成父志，宜也。”亦随自缢。
十八日，帝次腾越。二十日，发腾越。
及清师过腾越，直越磨盘山，入险要，固山额真等俱战亡。定国中书卢生桂降于吴三桂，告以伏兵机密，赎命求官。三桂即令搜捕伏兵。名望知事泄，不得已发炮出战。中伏亦发。名望为流矢中左目，自刎。国玺战死。定国坐山巅，闻炮失序，大惊曰：“兵败矣。”跨马而奔。将士皆散。稍定，乃问驾安在。或对曰：“将至茶山。”定国沉吟曰：“君臣俱死，无益也，姑他往以图再举。”遂率兵走孟艮。
二十四日，帝闻磨盘之败。百官争窜。昏夜失道，迷大谷中，比晓，仍故处也。辎重宫人为乱兵所掠。扈卫靳统武、旗鼓孙崇雅劫掠皇杠，降于清师。时溃兵散乱。敕沐天波率禁旅及文武百余前进。二十六日，抵囊本河。二十八日，抵铁壁关，即缅甸界也。缅酋遣使言：“众兵压境，诸蛮警惧。从官勿佩兵器，乃可入国。”马吉翔矫旨从之。
三十日，至蛮漠。缅人遣其头目通话曰：“缅土小邦，乃大明贡臣。今皇帝亲举玉趾以临，敢不伏而迎诸郊？唯是扈跸诸王及勋镇将军携有重兵，自宜次于外以图恢复疆宇。若入于小邦，是示天下以不武也，不重损我天朝威望乎？”天波见其势不可入，乃奏曰：“圣驾进缅，臣必居外矣。君臣南北，阻以大江之险，音问难通。请陛下以太子托臣，臣奉太子进茶山监国，一则可以在外调度，次亦可以遥为声援。此顾前虑后之长策，愿陛下决计。”帝曰：“兴废由天，非人力所能挽。太子尚有父子之情，奚忍遽离？”后兄华亭侯王维恭请于后，亦弗许。于是君臣哭别。
二月壬辰朔，帝次大金沙江，缅酋以四舟来迎。从官自觅舟江上，得从者六百四十六人，马九百四十余匹，俱由陆期会于缅甸。
十八日，帝次井亘。缅人止之。不听，前进。
二十四日，缅请大臣问故。帝遣马雄飞、邬昌琦赍敕书往谕。缅发神宗敕书，对校不同，疑其为伪。及见沐国公印，信之。盖缅国自万历二十三年请救不许，遂绝朝贡，故所知惟神宗故事也。
当是时，李定国已遣白文选率兵迎驾至哇城下，距驻跸五六十里，而为缅人隔绝。文选遂拔营去。
三月十七日，自河口分路。陆行者至哇城，对河离城五六里驻营。缅人疑兵夺国，率兵出战，杀伤多人。余乃散居村落。通政使束蕴金、中军姜水德缢死。
四月初三日，传谕守关者，驾已航海赴闽，兵勿复来。盖缅人畏兵，故马吉翔以此悦其心，而不知为其所愚也。沐天波、蒲缨、王启隆等谋乘间走户腊二撤。亦不许。
五月四日，缅王具龙舟鼓乐，遣人迎驾。五日，发井亘。七日，至哇城下，次于缅酋所居城对江。八日，进赭，始知前陆行者潘世荣等被缅人分给土人为奴，多自杀。缅人于赭置草殿数十间，编竹为城。从官各结茅散处。蛮男妇日来贸易。初至馈献颇丰，后乃渐薄。
八月望日，为缅国朝会之期。逼令沐天波以臣礼见，令天波跣足为诸蛮先，以夸耀于诸蛮。马吉翔、李国泰等犹以令节饮后弟王维恭家。维恭有女妓黎维新，已老矣，吉翔强之为梨园舞。维新泣下曰：“今何时，顾犹为歌舞欢耶？”吉翔等怒，挞之。蒲缨家复纵博喧呼，声彻于内。时帝卧病不能禁，叹息而已。
九月，缅人贡新谷。命分给从官之窘者。吉翔多私其亲故，邓凯以为言，吉翔击凯伤足。
十月戊子朔，礼官请颁庚子历。从之。
永历十四年（清顺治十七年）庚子正月丁巳朔，帝在赭，日欲出缅幸李定国营。定国恐以兵来，则缅人致难于帝。而在帝左右者，又皆偷安无智之徒，以此音尘不属。
九月，定国迎驾，屯于近地。奏云：“前后三十余本，不知曾到？今与缅王约何地交割？”帝以答敕付缅人。定国候久无消息，复拔营去。是时士君子皆散，唯余茸一二辈。马吉翔为大学士，与司礼监李国泰相为唇齿，惟恐定国之至，于是牢笼文武，凡欲某职某衔者，俱称门生。吉翔、国泰合奏大臣三日不举火，帝怒，以玺掷之。吉翔、国泰即椎碎分给。御史任国玺请东宫开讲，进宋末贤奸利害书。帝方览，国泰恶而去之。
永历十五年（清顺治十八年）辛丑正月辛亥朔，帝在赭。
二月二十八日，白文选密遣缅人赍本至，云：“不敢速进者，恐有害，必要缅王送出为上策。”数日后，距行在六七十里架浮桥，将渡，已而不果。
三月，有欲杀马吉翔、李国泰奉东宫而出者。事觉，被害。
五月，马吉翔、李国泰进宫讲书。御史任国玺曰：“上年请开讲，则迁延不行。今日势如累卵，祸急燃眉，不思出险而托之讲书。夫日讲经筵，必须科道侍班，议军事，则有皇亲沐国，岂翔、泰二人之私事哉？”奉旨着任国玺献出险策。国玺言：“能主入缅，必能主出缅。今日事势如此，卸肩于建言之人乎？”太常寺博士邓居诏、礼部主事王祖望各劾翔、泰。不省。
又谕礼部侍郎杨在讲书。赐坐。在以东宫典玺李崇贵侍立，不敢就坐。帝并赐祟贵坐。崇贵曰：“虽在乱亡，不敢废礼。今日蒙上赐，后日将谓臣欺幼主。”每讲，崇贵出外，讲毕而入。一日，东宫问哀公何名？在不能答。
二十三日，缅酋弟莽猛白弑兄自立，遣人索贺。
七月，复来言三载供亿之劳，索报礼。俱无以应。
是月十八日，缅人请吃咒水（即盟誓也），设宴于海中对山望海楼。马吉翔、李国泰挽百官同往，已而伏兵四起，悉被歼焉。惟沐天波觉其谋，出袖中锤，击杀十余人，被获，缚诸树以弩箭攒射之，死。是时，死者马吉翔、蒲缨、王维恭而下四十有二人，而其先以病卒与妇女惊窜自缢者不计。同行文武尽矣。
缅人又发兵围行在。帝几自缢。吉王同妃缢死。宫人命妇缢者不下百人。尽劫所有而去。
二十一日，缅人复修草殿，奉帝居之。曰：“此事非关吾国，因汝各营在外杀害地方，犯众怒耳。”
缅杀诸人后，有驰呼而至者，云：“勿害皇帝及黔国公。”盖恐清朝索之，思留以献也。而天波已先死。乃复治天波所居室，移帝眷属二十五人入居之，并进衣食。
八月，李定国以十六舟攻缅，复为所败，覆其五舟。乃与文选俱引还。
十一月十八日，帝召都督同知邓凯入，谓曰：“太后病矣，未知骸骨得归故里否？”又曰：“白文选未封亲王，马宝未封郡王，吾负之。滇、黔百姓，我师在彼，苦了多年，今又不知何如？”
十二月三日，缅人请帝移跸。皇太后、皇后及太子同行。三更渡河，始知其为清师也。盖三桂以重金购致之。
明年壬寅二月十三日，至滇城。四月二十五日，以红帛缢死。
定国既败还，而文选军在后，引而北。定国使其子嗣兴随文选以观去向。文选部下勒兵回向嗣兴，嗣兴怒，亦勒兵迎之。定国遽使召嗣兴还，曰：“吾兄弟数十人，今惟存吾与若耳，何忍更相残？吾前所以使尔随之者，冀其悔而复回，仍与我并力也。既勒兵相向，念已绝矣，任彼所之，吾自尽吾事可耳。”遂率所部向九龙江而进。文选北行，屯锡泊。清师至，遂降。
定国在九龙江闻报，东走景线。壬寅五月，至猛猎，士马死亡日众。定国乃置醮自述生平所为，如天命已绝，愿速死，毋徒苦众人。未几，闻滇城四月二十五日之事，定国遂病，以六月二十七日卒于军。
八月，嗣兴降，与刘文秀子震、艾能奇子承业俱入京，受世职。
孙可望死，其子袭王封。一代后，亦降为公。
三桂进爵为王，乃踞五华故宫，增修旧制。红亭碧沼，曲折依泉。杰阁无堂，参差因榭。冠以巍阙，缭以雕墙，广袤数十里。卉木之奇，运自两粤，器玩之丽，购自八闽，而管弦锦绮图书之属，则取之三吴。从圆圆之好也。三桂将进圆圆位正妃，辞曰：“妾以章台贱质，谬污琼寝。始于一顾之恩，继以千金之聘。流离契阔，幸保残躯。获与奉匝之役，分已过矣。今吾王析圭胙土，威震南天，正宜续鸾戚里，谐凤侯门。上则立体朝廷，下则垂型裨属。稽之大典，斯曰德齐。若欲蒂弱絮于绣ブ，培轻尘于玉几，既蹈非耦之嫌，必贻无仪之刺，是重妾之罪也。”三桂不得已，乃别娶中阃，而悍妒绝伦，群姬之艳而幸者辄杀之。惟圆圆屏谢铅华，幽居别苑，以顺适其意，不甚相轧。
圆圆之养姆曰陈，故幼从陈姓，本出于邢，于是府中皆称邢太太。居久之，三桂潜有异志。邢窥其微，以齿暮请为女道士。霞帔星冠，日拥药炉经卷而已。三桂治戎之暇，每至其处，必晤言移日。府中人遇三桂怒不可解事，邢为缓颊，则立解之。常曰：“吾晨夕焚修，为善是乐，他非所计耳。”内外咸敬礼之。
康熙癸丑岁，三桂反。出攻长沙，抗命。乙卯，僭尊号。丁巳，病死。伪周洪化，其孙也。戊午，诸王贝勒讨贼，驻军曲靖。赖将军平耿精忠，由福建进征粤西，亦从四川黄草坝直薄滇城，俘洪化斩之。籍其家，舞衫歌扇、稚蕙娇莺、联舻接轸俱入禁掖，而邢独不见于籍。
岁癸亥，金陵邵为章赴楚雄幕，访其实于乡长老，题绝句于壁曰：“百万雄师睥睨间，先朝一脉绝南蛮。擒人即是人擒路，谁道天公不好还？行营历历草凄凄，铜柱摩崖手自题。虎豹无睛威尚在，老军犹说旧平西。”邵有濡头之癖，落魄寡谐，诗故不甚显于时。
三余氏曰：东南人材，独萃粤西。论其尤者，如腾蛟殉国，式耜致身，十八之成仁，二张之遂志，非万里之长城耶？新兴连挫大敌，安西两蹶名王，亦中叶以来未有之勋矣。乃文武忠烈而君卒偷惰，虽无秦逆，终陷蛮乡耳。噫！竖子洵不足与谋哉。
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