经此变故，农民军的力量遭受了重创，杨安、甘老大和钟成的队伍被迫远遁，丹阳的治安很快得以恢复。然而，令白铭肇头疼的是，再也没有大股流寇接受招抚；但凡朝廷军队开赴的地方，农民军立即化整为零，或就地隐藏，或窜入他处；而当官军驻防后，又不时有贼人冒出，袭扰攻击兵力薄弱的区域。在接下来的一个多月里，白铭肇带着几千部队四处剿匪，除了偶有小获外，再也没能取得重大战果，反而损失了数百官军。他就象掉进蚊虫堆里的狮子，站也不是，卧也不是，挠也挠不到，咬也咬不着。</p>
在这种情况下，林九都和一些军官纷纷建议白铭肇对匪寇猖獗的地区采取断然措施，即屠村和屠城。开始的时候，受仁爱和民本思想教化多年的白铭肇还能坚持原则，顶住压力，拒绝众人的提案。但随着战事的延长，朝中弹劾他靡师费饷、庸碌无能的人越来越多，特别是成王殿下班师在即，朝里一片喜迎凯旋的氛围，同泰帝又两次下旨催促他快速剿贼后，白铭肇再也无法坚持，只能默许或同意属官的请求。</p>
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