幻兽（拥有特殊能力实力不一不好划分，总体实力介于二级神兽和三级神兽之间）：
梦幻【最强幻之精灵实力不弱于二级神兽】（超能力系）
它拥有所有神奇宝贝的遗传基因。可以随意变身和隐身，所以可以轻易地接近人类而不被发现。只有拥有纯洁的心灵和直面强者的勇气的人才能让其现身。
雪拉比（草系和超能力系）
能够穿梭时间在各地徘徊，据说雪拉比现身过的森林的草木生长得非常繁盛。因此被称作为森林之神。
基拉祈（钢系和超能力系）
1000年苏醒一次，并且苏醒的时间只有7天的梦幻宠物小精灵——基拉祈。它会在听到纯洁的歌声后从千年的沉睡中醒来。正如它的名字——“祈愿宠物小精灵”，它拥有可以实现任何愿望的能力。许愿者要让基拉祈腹部的第三只眼——“真实之眼”睁开，然后看着第三只眼许下愿望。在基拉祈的头上贴有显示愿望的“许愿笺”。
玛纳霏（水系）专属超能力系绝招——交换意志
身体的百分之八十都是水，很容易受到周围环境影响的宠物小精灵。利用与生俱来的神奇力量，能和任何宠物小精灵心灵相通。
洁咪（草系）专属草系绝招——种子闪光弹
能够分解掉大气当中的毒素，即使是荒芜的大地也能使之在瞬间变成花海。当它被人类温柔地抱在怀中，感受到感恩之心时，全身的鲜花就会绽放。
比克提尼（火焰和超能力系）
体内制造出无限的能量，能将能量分给碰触到的事物。当它碰它的伙伴时，它可以共享能量。
凯路迪欧（水系和格斗系）觉醒状态专属绝招——神秘之剑
凯路迪欧拥有一般和觉醒两种状态。奔走于全世界江河湖海的水面上，会现身于美丽的河畔。蹄子里喷出水流在水面上滑行。用擅长的蹄技战斗。
代欧奇西斯（超能力系）专属超能力系绝招——精神增压
当宇宙病毒被激光照射时，发生突变而形成的宠物小精灵，身体的形状很适合快速移动。代欧奇西斯能够变幻全方位、攻击、防御和速度四个形态迷惑对手。
噩梦神达克莱伊（恶系）专属恶系绝招——黑洞
靠引诱对方陷入睡眠使人类和宠物小精灵做噩梦，从而来将他们驱逐出自己的领地。
美梦神克雷色利亚（超能力系）专属超能力绝招——新月之舞
被称为新月的化身，传说中只要带着克雷色利亚的羽毛睡觉就能让人梦见愉快的事。
美洛耶塔（普通和超能力系）舞步形态专属技能——古代之歌
美洛耶塔拥有一般和舞步两种形态，她可以用特殊的发声法唱出的旋律可以自由自在地操纵听者的情感。
席多蓝恩（钢系和火焰系）专属绝招——熔岩风暴
火山口宠物小精灵，生活于火山的洞穴之中，能用十字形的爪子紧抓住物体，行走于峭壁或天花板上。
三级神兽：关东地区传说中的三圣鸟（火焰鸟、急冻鸟、闪电鸟）【亚细亚岛的特殊三神鸟拥有介于二级神兽和三级神兽之间的实力】
成都地区传说中的三圣兽（炎帝、雷皇、水君）【《幻影的霸者》中三只特殊颜色的三圣兽为凤王复活的三圣兽拥有介于二级神兽和三级神兽之间的实力】
芳缘地区传说中的三圣柱（钢圣柱雷吉斯奇鲁、岩圣柱雷吉洛克、冰圣柱雷吉艾斯基）
神奥地区传说中的三圣姑（黄圣姑由克希、蓝圣姑亚克诺姆、红圣姑艾姆利多）
伊修地区传说中的三圣剑（牛圣剑代拉基翁、羊圣剑勾帕路翁、鹿圣剑毕力吉翁）
伊修地区传说中的三圣云（土地云、雷电云、龙卷云）【土地云拥有介于二级神兽和三级神兽之间的实力】
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