失去了“芬尼亚社”的资助，霍兰又与扎林斯基合作，建造了他的第四艘潜艇“扎林斯基”号。
接着，霍兰从美国海军部得到了15万美元的经费，又开始了他的第五艘潜艇的设计。他反复研究并数易方案，终于建成了他的第五艘潜艇“潜水者”号。
该艇长26米，拥有水面航行的推进装置蒸汽机动力装置和水下潜航的推进装置电动机，“潜水者”号由此成为了潜艇双推进系统的鼻祖。
但是，美国海军部出于战争的需要，在“潜水者”号建造期间，就要求霍兰能够使“潜水者”号用于水面作战。但霍兰却认为，按照这种要求是不能制造出令人满意的潜艇的。
于是，霍兰放弃了“潜水者”号的建造工作，归还了美国海军部的经费，开始用自己的钱来设计建造一艘新潜艇。
1897年5月17日，霍兰成功地制造出了“霍兰－6”号潜艇。该艇长15米，装有33.1千瓦汽油发动机和以蓄电池为能源的电动机，是一艘采用双推进的最新潜艇。
“霍兰－6”号潜艇在水面航行时，以汽油发动机为动力，航速可达每小时7海里，续航力为1000海里。在水下潜航时，则以电动机为动力，航速可达每小时5海里，续航力50海里。
该潜艇共有5名艇员，武器为一具艇首有3枚鱼雷的发射管和前后各1门的火炮，火炮瞄准靠操纵潜艇艇体对准目标。
双推进系统在该艇上的运用，使这艘潜艇取得了潜艇发展史上前所未有的成功，其优异的性能使之成为现代潜艇的鼻祖。于是，英国、日本纷纷购进仿制，开始了潜艇时代，从而奠定了霍兰作为“现代潜艇之父”的地位。
这样一艘潜艇的设计，无疑是一个领先于时代的天才设计，但是霍兰的成就并没有给他本人带来任何的好处。
由于美国海军部一些官员的偏见和挑剔，这艘潜艇不仅没有被海军部采用，反而使这位大发明家受到了恶毒的嘲讽和攻击，被冠以“骗子”和“白痴”的头衔。
1904年，无情的打击使霍兰愤然辞职。从此，一代潜艇巨匠被迫停止了其心爱的事业，整日里悒悒不乐，以酒消愁等死。
不过到了1907年7月份的时候，老霍兰的命运开始发生了改变。几个神秘的会说英语的华人深夜找上门来，说愿意提供巨额资金供他继续研制潜艇。
虽然对华人没有什么好感，但是不能研制心爱的潜艇，使老霍兰度日如年，生不如死。抱着病急乱投医的心态，老霍兰答应了下来。
于是，神秘的华人头子马上拿出一张5万美元的支票，给老霍兰当安家费，让他不要告诉任何人，安顿好家人之后，3天后就随他们去一个研制潜艇的天堂。看到5万美元的安家费之后，老霍兰马上就相信了对方的诚意。3天之后，”现代潜艇之父”约翰。霍兰在美国离奇失踪。
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