后来，大家从管理员口中得知，古代神奇宝贝正在在市区里大闹，现在正在这里捕获逃出的神奇宝贝们，大家得知了这个消息后，立刻前往了捕获地点。
到达捕获地点后，就看到了镰刀盔和太古盔甲在角落里。瓢太准备制服他们，小智他们也表示要帮忙，于是瓢太决定用头盖龙吸引他们的注意力，而小智他们则是去制服他们。
“头盖龙，使用喷射火焰！”头盖龙吐出了火焰，火焰引起了爆炸，吸引了他们的注意力。
“皮卡丘，趁现在！”“胡说树也上吧！”“v仔兽你也去！”皮卡丘他们接到指示就立刻冲了上去，可是镰刀盔和太古盔甲也注意到了他们，使出绝招。v仔兽凭借着快速的反应力躲开了攻击，但是胡说树和皮卡丘却因为没反应过来中招了。
“头盖龙，使用意念头锤！”“v仔兽，v仔头槌！”v仔兽和头盖龙从两个方向使用了头槌绝招，就在小越他们觉得形势大好，即将胜利的时候四个橡胶手臂伸了过来，将化石神奇宝贝们和v仔兽抓住了。
“啊哈哈，三只古代神奇宝贝和v仔兽都一口气抓到了！”武藏在机器人上得意的说道。
“那个是。。。”“化石复活器！”瓢太和研究员的对话使得小越他们吃了一惊。
“。。。（火箭队台词）”“可恶的火箭队，快把v仔兽和古代神奇宝贝们还来！”小越对着火箭队愤怒的说道。“那可不行，我们可是要组建古代神奇宝贝军团的。”小次郎。
“既然如此，装甲进化！”小越拿出了图鉴，一道橘红色的光芒射向v仔兽。
“v仔兽，装甲进化－－－－－－－－－－燃烧的勇气！烈焰兽！”烈焰兽的身影出现，可是却没有使自己脱困。“喵哈哈，我们这次可是使用的橡胶啊喵，不仅电击对我们无效，而且v仔兽在怎么进化也撑不开啊喵。”喵喵在上面得意的说道。
“既然如此，烈焰兽，使用火。。。啊！烈焰兽，你没事吧？”小越本来打算让烈焰兽使用火焰飞弹橡胶融化掉的，可是化石翼龙冲了过来，直接将火箭队给撞倒了，这时橡胶松开了烈焰兽和古代神奇宝贝们掉到了地上。“小越，我没事。”烈焰兽的话使得小越松了一口气。
而这时研究员们也将太古盔甲和镰刀盔给收了起来。可是危机还没有解除，化石翼龙使用了超级冲击，头盖龙虽然挡住了一小会，可是超级冲击的力量也很强，直接将大家给撞飞了出去，烈焰兽也因为突然受到了伤害退化回了v仔兽。
正所谓福不双至，祸不单行，这时化石翼龙又对着意外在一起的小智和小越使用了破坏死光，小智和小越连忙护住了皮卡丘和v仔兽，正当他们准备听天由命的时候，小光的卷卷耳和波加曼过来了，用急冻光线和泡沫光线成功挡下了破坏死光。
“小智、小越，没问题吧？”小光急忙跑了过来。“小光！”小智和小越看着小光兴奋地说道。
“这里就交给我们来对付吧！”小光和她的神奇宝贝们站在了小智和小越的面前。这时化石翼龙又使出了超级冲击。“有是超级冲击啊！”小刚。“没问题，你们看好了。要去喽，波加曼、卷卷耳！”小光从容的说道，这使得小智他们都看向了小光。
化石翼龙冲向了小光。“还没有，要等他再过来一点。”小光对着波加曼和卷卷耳说道。等化石翼龙更加接近的时候，小光喊道：“就是现在，去吧！”
在小光的指示下，波加曼和卷卷耳快速的跑向了化石翼龙，纵身一跃，接着就开始旋转身体，从化石翼龙的两边躲了过去。小智和小越看到了那个动作，产生了一些想法。
“快把化石翼龙抓起来！”在小光的指令下，波加曼和卷卷耳再次一跳，将化石翼龙压到了地面。研究员也趁现在收服了化石翼龙。
这时，悲催的火箭队好不容易才将机器推起来，不得不感叹一下他们的怪力啊。可是起来后他们才突然发现抓到的神奇宝贝逃了，瓢太也准备对付他们，于是开始逃跑。
“v仔兽，你还可以吗？”“没问题的，小越。”“好，装甲进化！”小越又拿出了图鉴。
“v仔兽，装甲进化－－－－－－－－－－坚固的友情，雷龙兽！”“瓢太先生，快上来！”小越在雷龙兽进化完后立刻一翻身爬到了雷龙兽的背上然后对瓢太伸出了手。“恩，回来吧，头盖龙。”瓢太上去后收回了头盖龙。
“雷龙兽，我们走！”“知道了。”雷龙兽快速的冲了上去，宛如一条黑色的闪电。
“喵喵，快想办法啊！”武藏对着喵喵说道。“交给我吧喵。”喵喵按下了一个按钮，一个飞弹出来了。“这种攻击是没用的，雷龙兽！”“明白，闪电角击！”雷龙兽使用了闪电角击，将飞弹打成两半。但是雷龙兽的攻击还没有结束，他继续使用了闪电角击，橡剑一样的闪电将化石复活器打了下来。“就是现在，头盖龙，使用意念头锤！”瓢太趁现在扔出头盖龙的球，头盖龙也立刻使用了意念头锤，将火箭队打飞了。“好讨厌的感觉！”火箭队留下这句话就再次飞上天空。
“谢谢你们，小越，还有v仔兽，多亏你们我们才能拿回化石复活器。”研究人员感谢道。
“各位，真的非常感谢你们的协助。”君莎小姐过来敬了个礼说道。
“哪里哪里，你不要放在心上，如果是为了君莎小姐的话小生无论是面对对么巨大的敌人。。。麻掉了麻了。。。”事情一结束小刚就又跑去和君莎小姐搭讪了，可是还是被**蛙的毒刺一击ko，然后被拖走了。
“瓢太先生，请明天接受我的挑战。”小越对着瓢太说道。“还有我，我也要挑战。”小智也是不甘示弱的说。
“很好，我接受你们的挑战，不过由于是小越先提出的，所以明天我会先和小越对战，可以吧？”“恩，好的。”小智和小越一齐说道。“对了，小光，你能从现在开始陪我进行特训吗？”小智和小越异口同声地说道。不过下一刻他们就互相瞪着对方：“小智（小越）你该不会也想到了吧？”小智和小越有是异口同声地说道。“呃，如果是我能帮到你们的话，我非常乐意。”小光打破了这个气氛。
紧接着，小智和小越又一次开始特训，准备迎战钢铁道馆。。。。;
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