东尼欧将大家带到大厅的壁画前：“在研究室里并没有叫做奥拉席翁的曲子，要是存在的话，就只能在这里了。”小智看着四周大大小小的音盘说道：“到底是哪一个啊？”小光也是说道：“这样子怎么知道嘛！”小越则是问爱丽丝：“爱丽丝，你有什么线索吗？”爱丽丝听到小越的话后低头回忆，想起了自己奶奶教这首曲子的事情，那个时候她曾经说过奥拉席翁的含义是祈祷。爱丽丝突然睁开眼睛，然后拿着手里的曲子对准壁画然后自言自语道：“奥拉席翁的意思是。。祈祷。”然后她就看向一幅在树上吹着笛子的少女，然后向壁画的下方看去，还是有很多音盘，但是爱丽丝最后凭借着照片上的图案找到了奥拉席翁。
最后大家成功找到了奥拉席翁，爱丽丝也拿出了小火焰猴，准备乘坐热气球升空。而小刚和古乐兽此时则是和乔伊小姐一起帮助人们疏散和保护人们，在大多数人都疏散完后，小刚和古乐兽又担心的看向时空之塔，希望小智他们能够成功。
在小智他们飞行的途中，波加曼不小心被迪亚鲁卡他们所造成的震动掉下了热气球，不过小智及时派出姆克鸟救下了波加曼，波加曼骑着姆克鸟飞上天空。随后又是一阵能量弹，打破了热气球的边缘，小光因为抓不稳眼看就要掉下去。“小光！”小智和小越及时拉住了小光的手，但是帕鲁奇亚偏偏就在这时飞过，产生的风压使得小越和小智松开手，小光因此掉了下去，不过幸运的是小光正好掉到了时空之塔的楼梯上，这使得小智和小越松了口气。
但是事情还没有结束，迪亚鲁卡此时也追着帕鲁奇亚经过热气球，小智和小越也被风压给吹下热气球，在滑过建筑物后，最后有惊无险的降落到小光的身边。而正当爱丽丝他们想飞回去接小智他们的时候，迪亚鲁卡的绝招发出，帕鲁奇亚躲开了攻击，但是眼看就要打中热气球上面，情况很危急，不过达克莱伊出手相助，用身体挡住了攻击。不过热气球到最后还是坠落了，爱丽丝站在桥上，但是好像不太稳，最后在大舌舔和东尼欧的帮助下终于安全了。小智他们看到后也终于放心了。
“小智，我想到了一个好办法。”小越突然对着小智他们说道，“出来吧，奇鲁莉安！”小光及时反应过来：“对了，只要使用奇鲁莉安的瞬间移动，就能一下子到达塔顶了。”小越点了一下头，然后对着奇鲁莉安说道：“奇鲁莉安，使用瞬间移动。”但是奇鲁莉安却摇了摇头，用心电感应对着小智他们说道：“不行，现在的空间实在是太不稳定了，如果强行瞬间移动的话，会偏离目标很多，说不准会比现在还要远。”“是吗？”小越有点失望的低下了头。
小智则是说道：“好了没关系的小越，奇鲁莉安也是很强的，可以让他帮忙掩护我们上塔，出来吧，草苗龟、长尾怪手，你们也来帮忙！”小智又派出了长尾怪手和草苗龟来帮忙。“说的也是，我们快点上去吧！”小越也是第一个就冲了上去，小智和小光也跟在了后面。途中迪亚鲁卡和帕鲁奇亚也在战斗中使出了绝招要波及到这里，但是全部都被长尾怪手、草苗龟和奇鲁莉安的绝招给抵消，一行人顺利的前进着。
在把镜头转向小刚这里，小刚从水池里救出了为了救爱丽丝而受伤的达克莱伊。而爱丽丝和东尼欧也过来了，爱丽丝担心的看着达克莱伊，昏迷的达克莱伊想起了之前和爱丽丝奶奶的相遇。
四周的事物消失的速度随着迪亚鲁卡和帕鲁奇亚对战的进行变得越来越快，而小智他们这时也在路上遇到了麻烦，楼梯在他们上来的时候直接消失了。不过小光也用泳气鼬的水枪和卷卷耳的急冻光线做出了冰的楼梯，一行人解决了麻烦后继续前进并且加快步伐，好早点结束这场灾难。
而这时所有的神奇宝贝们都在使用绝招来减缓空间的崩溃，爱丽丝看着不断战斗的两个神兽，大声喊到：“够了！快住手！”可是他们完全不听，自己聚集能量，东尼欧拿着电脑说道：“糟了，要是他们以这种能量在使用一次绝招的话，这个空间会承受不住的！”达克莱伊也睁开了眼睛，然后飞上天空，古乐兽看到这个样子，也张开耳朵飞上了天空。小刚叫道：“古乐兽，你要去哪里啊？”古乐兽坚定的看着正在战斗的两只神兽，对着小刚说道：“小刚，古乐兽要和达克莱伊一起阻止这次的绝招，这是古乐兽现在唯一可以做的事了古乐。”不顾小刚的喊叫，古乐兽和达克莱伊一起飞到了天空上，然后一起大叫：“快住手（古乐）！”然后他们的绝招眼看就要砸到古乐兽他们的身上。
“古乐~！”古乐兽大叫一声，进化之力全开，头上的红色三角发出了璀璨的光芒，光芒形成一个屏障防护住了一边的绝招，而达克莱伊则是从身体里爆发出黑色的能量，抵挡了另外一边的攻击。激烈的冲撞引起了一部分空间的消失，正好也让正在前进的小智他们看见了他们努力的身影。“达克莱伊、古乐兽。”小智看着他们平静的叫道。而小光则是提起精神：“没问题的，我们走！”小越也点了一下头：“恩，我们也要快一点。”v仔兽最后说道：“不能辜负他们为我们努力争取的时间！”大家点了一下头，然后一起加快了步伐。
就在大家前进的时候，突然一阵震动，小智脚下的路消失了，小智眼看就要掉下去。“小智！”小光和小越拉住了小智，但是好像力气不太够，始终不能把小智拉上来，而波加曼也拉着小光，不让她掉下去。可是小光和小越脚下的空间再次消失，然后三人一起摔了下去。
“weiwei~（奇鲁~）！”泳气鼬和奇鲁莉安一起发力，泳气鼬使用了水枪将小智和小光冲到了另一边的楼梯上，而奇鲁莉安则是用念力来将小越送到了小智他们那里。
“谢谢你们！泳气鼬，奇鲁莉安！”小智对着他们道谢。小越看着v仔兽说道：“v仔兽，还有皮卡丘，大家就请你们照顾了！”“交给我们了！”v仔兽和皮卡丘拍了一下胸脯。小越看着v仔兽说道：“对了！v仔兽，你把大家送上去吧！装甲进化！”小越再次拿出图鉴，图鉴发出了蓝色的光芒。“v仔兽装甲进化－－－－－－－雷龙兽！”小越对着他们说道：“坐到雷龙兽的背上吧！这样多少能快一些！”小越说完，除了长尾怪手以外的四只神奇宝贝就一起坐在了雷龙兽的背上。（长尾怪手在姆克鸟的身上），雷龙兽说道：“抓好了！”然后一下就离开了。
“我们也走吧。”小越说完小智和小光就点了一下头，然后三人外带一只波加曼从另一个入口前进了。
时空之塔在时间的流逝中不断地消失着，而后古乐兽和达克莱伊终于没有力气继续支持下去了，红色与黑色的光芒渐渐消失了。然后迪亚鲁卡和帕鲁奇亚看没有人继续干扰他们了，于是又对着他们放出大招，想把他们消灭。
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